民國初年以後,大仙巖與碧雲寺的管理人均為廖炭居士。

 

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民國4年德融禪師擔任本寺第八代住持。

民國4年廖炭居士為求寺運興隆,特親往日本視察,返回後與 德融禪師、及配合各地士紳擴大募捐,精心闢劃改築大雄寶殿,仿日本奈良大佛寺之模式,費時十年始完成。整體建築是以「日本佛寺外貌」為表,以「中國寺廟建築格局」為體。

 

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民國14年大雄寶殿建造完成。梵宇莊嚴宏偉,雕樑畫棟,結構獨樹一格,全台僅見。據行政院文建會古蹟調查,本寺最特殊之處在於寺內大雄寶殿屋頂為「日本式屋瓦」式樣,為全省僅有的日式屋頂構造的二座寺廟之一。

 

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民國19年冬至發生震災,尤以嘉南地區更甚,本寺亦難逃浩劫,大雄寶殿震損,宜須重整,由施烏拋居士配合寺眾發動募捐,向附近仙草埔、白河、杭內、岩前、白水溪、三層崎、深坑仔等地信徒募得數千圓,修繕寺貌,惜因限於經費,仍多殘缺,至台灣光復後才逐年修復舊觀。

 

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民國33年日人實施皇民化運動,禁止參拜神佛,本寺乃成立維持財團大仙寺後援會,由白河街長日人五十里子之作兼任會長,並派員駐寺處理寺務。

 

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民國34年台灣光復,由白河鎮地方人士組織管理委員會,推選何火爐居士為委員長,主持寺務。經其多方奔走,將歸屬日人的寺產重歸本寺管理。

 

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民國35年管委會禮請 開參禪師為第九代住持,海靜法師為監院,並推選何火爐、吳石、吳清池等居士為本寺財產管理人,另聘蘇祈財為外務監院。

 

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民國37年管委會配合住持 開參禪師發動寺眾募捐數拾萬元,興建觀音殿,於三十九年竣工。

 

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民國39年由住持 開參禪師帶領規劃興建南北兩塔及小山門。

 

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民國40年興建大雄寶殿南北側兩廊香客樓房。

 

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民國41年冬期,本寺住持 開參禪師,因感於本省戒法久未宏傳,故謹依中國佛教會傳戒規則,啟建光復後全省首次護國三壇大戒。戒子共有一百柒拾伍人,在家戒子有參佰餘人,道場莊嚴盛大,為當時全省一大勝事。

 

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民國42年由白河鎮仙草埔信徒為主體,申請成立中國佛教會台灣省台南縣佛教支會,本寺監院海靜法師當選榮任首屆理事長,故會址設於本寺。

民國42年白河地區於本寺舉辦全國詩人大會,遠近地區前來參加的文人雅士,不下數百人,齊聚一堂,吟詠詩歌,聯袂唱和,盛況空前。

 

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民國43年興建齋堂及三寶殿兩側樓房。

 

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民國45年經政府核准成立大仙寺管理委員會,由吳八居士當選首屆主任委員。

 

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民國45年前臺灣省主席 嚴副總統家淦蒞臨本寺,並題賜「妙相莊嚴」匾額一座。